Решение «1с меркурий» обеспечивает хранение, обработку и выборку полученной информации. При этом решение может использоваться как полностью самостоятельная конфигурация, так и работать в связке с типовыми решениями системы программ «1С:Предприятие 8», передавая необходимую информацию в учетную систему пользователя, что позволяет избежать ручного дублирования ввода информации, например, при оформлении Товарно-транспортных накладных (Форма ТОРГ-12). С помощью универсального формата обмена данными EnterpriseData, версия используемого формата 1.5, реализован обмен данными по следующему сценарию работы: первоначальный ввод документов осуществляется в «1С:Управление ветеринарными сертификатами. Интеграция с ФГИС Меркурий», а затем выгружается в учетную систему.

Функционал модуля постоянно развивается, появляются новые возможности и адаптация под новые требования государственных органов и просьбы пользователей. Множество опций позволяют реализовывать самые различные схемы работы, подстраиваться под индивидуальные процессы предприятия.

Основное назначение системы ФГИС «Меркурий» определено как сертификация и обеспечение надзора за производством, оборотом и перемещением товаров животного происхождения, чтобы повысить безопасность продукта и создать единую информационную систему ветеринарии.